Изследователи от Висшето училище по икономика и Института по биоорганична химия на Руската академия на науките показаха ефективността на Т-клетъчния имунен отговор срещу омикронния вариант на SARS-CoV-2.
При 90 процента от ваксинираните московчани Т-клетъчният имунитет е толкова ефективен срещу омикрон, колкото и срещу други щамове.    
  Руски учени оцениха силата на Т-клетъчния имунен отговор към омикрон / ©Getty images Резултатите от изследването са публикувани на портала bioRxiv.
Омикронният щам на вируса SARS-CoV-2 предизвика нова вълна от пандемия по целия свят. Появилите се мутации във вируса му позволяват да се разпространява по-ефективно и да избягва антителата, в резултат на което вече болните и ваксинираните се заразяват все повече.
В същото време, според последните данни, тежестта на хода при ваксинираните е с порядък по-ниска, отколкото при тези, които не са се сблъсквали с вируса.
  Учените предполагат, че това може да се обясни с няколко фактора.
Първо, щамът omicron инфектира човешките клетки по-бавно, и второ, съществува хипотеза, свързваща лекия ход на заболяването с ефективното функциониране на Т-клетъчния имунитет.  
За да потвърди това предположение, екип от учени от Факултета по биология и биотехнология на Висшето училище по икономика и Института по биоорганична химия на Руската академия на науките (Степан Нерсисян, Антон Жянов, Алексей Галатенко, Максим Шкурников, Мария Захарова, Ирина Ишина, Инна Курбацкая, Азад Мамедов, Александър Габибов и Александър Тоневицки) изследваха омикрон-щам за наличието на мутации, които му позволяват да се скрие от Т-клетъчния имунен отговор.

  Базовият щам на Ухан и делта пептидите се свързват добре с молекулата HLA-DRB1*03:01 (висока оранжева колона вляво), докато омикронните пептиди вече не се разпознават от тази молекула / ©HSE Press Service
Базовият щам на Ухан и делта пептидите се свързват добре с молекулата HLA-DRB1*03:01 (висока оранжева колона вляво), докато омикронните пептиди вече не се разпознават от тази молекула / ©HSE Press Service
Развитието на Т-клетъчния отговор започва с разпознаването на вирусни пептиди (къси фрагменти от протеини) от молекули на човешкия основен комплекс за хистосъвместимост (HLA).
Колкото повече пептиди се разпознават, толкова по-бързо и по-ефективно действа Т-клетъчният имунитет.
Мутациите на вируса могат да променят тези пептиди, така че те вече да не се разпознават от HLA молекулите и Т-клетъчният отговор е по-малко ефективен.   Алгоритъмът за биоинформатика на T-CoV показа, че щамът Omicron не е в състояние да се скрие от нито една от молекулите на HLA.
Въпреки това бяха идентифицирани редица варианти на HLA молекули, които започнаха да разпознават по-лошо S-протеина на омикрон.
Ярка находка се оказа вариант на молекулата HLA-DRB1*03:01. Най-важният пептид на вируса е изчезнал от него.
  Изчисленията на биоинформатиците бяха тествани експериментално в лаборатория. Учените са доказали, че няма свързване между омикронните пептиди и молекулата HLA-DRB1*03:01, експресирана in vitro (подобни експерименти се провеждат извън тялото).   Висшето училище по икономика се доближи до разбирането как започват пожарите, земетресенията се разпространяват...
Изследователи от лабораторията за моделиране и управление на сложни системи HSE предложиха липсващия компонент на механизма на самоорганизираната критичност, който позволява възпроизвеждане... naked-science.ru

Изследователите подчертават, че оригиналният пептид от базовия щам и делта на Ухан е ефективно разпознат от тази молекула.
Авторите на статията обръщат внимание на факта, че идентифицираният вариант HLA-DRB1 * 03:01 присъства в голям процент от населението на света, например при 8,9 процента от европейците, 10 процента от жителите на Москва.  
„Разнообразието на популациите на вариантите на HLA молекули, както и спецификата на тяхната работа, не позволяват на вируса да избяга от Т-клетъчния имунен отговор. Вирусът обаче успя да скрие своя S-протеин от една от молекулите HLA.
Важно е повечето ваксини срещу Covid-19 (ваксините Sputnik V, Pfizer и Moderna, AstraZeneca и някои други) да носят този вирусен протеин. Това означава, че хората с вариант HLA-DRB1*03:01 (около 10 процента в Москва), ваксинирани със S-протеин, може да са по-трудни за понасяне на болестта, причинена от щама омикрон“, каза Александър Тоневицки, декан на HSE. Биологично-биотехнологичен факултет. Работата на изследователите на HSE беше подкрепена от Сбербанк.